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Enregistrement W2330539180 · doi:10.1093/neuonc/nou238.5

AI-05 * IMPACT OF GBM MICROENVIRONMENT ON EXPRESSION PROFILE OF BONE MARROW DERIVED PROGENITOR CELLS

2014· article· en· W2330539180 sur OpenAlexaff
Kelly Burrell, Sanjay K. Singh, Sameer Agnihotri, Rićhard P. Hill, Kenneth Aldape, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyProgenitor cellTumor microenvironmentCancer researchBone marrowGliomaStem cellCell biologyImmunologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have recently shown that bone marrow derived cells (BMDC) provide a distinct tumor region dependent contribution to glioblastoma multiforme (GBM) neovascularization. The influence of GBM microenvironment on differentiation and modulation of expression factors by BMDC however remains unknown. In this study we establish the differential expression profile of BMDC as a consequence of recruitment and interaction with the GBM microenvironment and in response to radiation (RTx) and anti-angiogenic therapy (AATx). Chimeric mice with reconstituted green-fluorescent bone marrow were used to create intracranial GBM xenografts, by implanting red fluorescent glioma stem cells or U87 into the frontal lobes. Subsequently, BMDC recruited to the GBM were isolated from the GBM cells using FACS during GBM growth, and following treatment (RTx and AATx). RNA was extracted from both FACS-purified BMDC and GBM cells, and mRNA and miRNA array analyses were performed. We compared the expression profiles to systemic BMDC derived from control donor mice. BMDCs were found to exhibit significant plasticity and altered their expression profiles based on stage of GBM growth and in response to therapy. TGFb was significantly upregulated in BMDCs following recruitment to GBMs, with a compensatory increase in expression of IL6,4,8 by GBM cells. BMDC up-regulate cytokines, IFNG, CXCL and TNF pathways, and transcriptional regulators, SMAD2, all of which are able to influence the tumor microenvironment. BMDCs also prove to express angiogenic factors and angioMIRs, with a distinct differential expression pattern based on stage of GBM growth and in response to therapy. We demonstrate that a significant cross-talk exists between BMDC in the tumor microenvironment and GBM cells. There is a distinct angiogenic and invasive profile of BMDC once recruited to the GBM. Furthermore, recruited BMDC provide a source of angiogenic factors, that are differentially expressed based on the stage of GBM growth and in response to therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,106

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0320,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
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