Common Themes in RNA Subcellular Transport, Stress Granule Formation and Abnormal Protein Aggregation
Notice bibliographique
Résumé
Control of protein synthesis and quality are critical steps to support eukaryotic cells maintenance and survival. Two very distinctive mechanisms emerge as key checkpoints of protein synthesis regulation. The first one is the delivery of mRNA molecules, packed into ribonucleoprotein (mRNP) granules, to specific subcellular regions in order to restrict protein synthesis to distinct cytoplasmic domains. In the presence of cellular stress or injury, translation is aborted by sequestering mRNA molecules into a sub-type of RNP particles called stress granules (SGs). The second mechanism deals with the folding state and further processing of synthesized proteins. Misbehavior of a particular protein, affecting its processing, functioning, and/or conformation can cause the formation of protein inclusions called aggresomes. Interestingly, self-aggregation of abnormal proteins is one of the leading causes of neurodegenerative disorders. Recently, intracellular transport directed by microtubule-motors, has emerged as an important step in the assembly and dynamic of SGs and aggresomes. This mechanism allows for a precise temporal and spatial trafficking of RNA and protein complexes. Furthermore, it facilitates the regulation of the RNA silencing domains and targets abnormal protein aggregates for degradation. In this review we will explore the specific and common features of mRNA transport and of SG and aggresome formation, and will provide details on the role of the microtubule network and motors in their movement and dynamics. Keywords: Abnormal protein aggregates, aggresome, cell stress, cytoskeleton, dynein, kinesin, RNP, stress granules, RNA Subcellular Transport, Drosophila S2 cells, bicoid mRNA, prion-like proteins, neurodegenerative disorders, Double knockdown (KD) experiments
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».