An ancient prevertebrate Na<sup>+</sup>-nucleoside cotransporter (hfCNT) from the Pacific hagfish (<i>Eptatretus stouti</i>)
Notice bibliographique
Résumé
The human concentrative (Na+-linked) plasma membrane transport proteins hCNT1, hCNT2, and hCNT3 are pyrimidine nucleoside-selective (system cit), purine nucleoside-selective (system cif), or broadly selective for both pyrimidine and purine nucleosides (system cib), respectively. All have orthologs in other mammalian species and belong to a gene family (CNT) that has members in insects, nematodes, pathogenic yeast, and bacteria. Here, we report the cDNA cloning and functional characterization of a CNT family member from an ancient marine prevertebrate, the Pacific hagfish (Eptatretus stouti). This Na+-nucleoside symporter, designated hfCNT, is the first transport protein to be characterized in detail in hagfish and is a 683-amino acid residue protein with 13 predicted transmembrane helical segments (TMs). hfCNT was 52, 50, and 57% identical in sequence to hCNT1, hCNT2, and hCNT3, respectively. Similarity to hCNT3 was particularly marked in the TM 4-13 region. When produced in Xenopus oocytes, hfCNT exhibited the transport properties of system cib, with uridine, thymidine, and inosine apparent K(m) values of 10-45 microM. The antiviral nucleoside drugs 3'-azido-3'-deoxythymidine, 2',3'-dideoxycytidine, and 2',3'-dideoxyinosine were also transported. Simultaneous measurement of uridine-evoked currents and radiolabeled uridine uptake under voltage-clamp conditions gave a Na+-to-uridine coupling ratio of 2:1 (cf. 2:1 for hCNT3 and 1:1 for hCNT1/2). The apparent K50 value for Na+ activation was >100 mM. A 50:50 chimera between hfCNT and hCNT1 (TMs 7-13 of hfCNT replaced by those of hCNT1) exhibited hCNT1-like cation interactions, establishing that the structural determinants of cation stoichiometry and binding affinity were located within the carboxy-terminal half of the protein. The high degree of sequence similarity between hfCNT and hCNT3 may indicate functional constraints on the primary structure of the transporter and suggests that cib-type CNTs fulfill important physiological functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».