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Enregistrement W2331120883 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs12-p1-05-05

Abstract P1-05-05: Podocalyxin is a key regulator of breast cancer progression and metastasis.

2012· article· en· W2331120883 sur OpenAlexaff
K. A. Snyder, Michael R. Hughes, Marcia L. Graves, Calvin D. Roskelly, Kelly M. McNagny

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPodocalyxinCancer researchMetastasisCancer cellCancerBiologySmall hairpin RNABreast cancerMedicineImmunologyPathologyCell cultureGene knockdownInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Podocalyxin (gene name Podxl) is a CD34-related sialomucin that has been shown to be important in regulating cell adhesion, migration, and polarity of hematopoietic progenitors and vascular endothelia. In breast cancer, we have shown that podocalyxin is overexpressed on a subset of node-negative tumors and its expression is strongly associated with poor overall survival. To determine whether podocalyxin directly regulates breast cancer cell behavior, we ectopically expressed podocalyxin in the human breast cancer cell line, MCF7, which expresses low levels of endogenous podocalyxin, is minimally invasive, and non-metastatic. Upon ectopic expression of podocalyxin, MCF7 “bulge apically”, produce apical and lateral microvilli, are less adhesive in vitro, and are delayed in targeting integrins to the basolateral surface. In contrast to MCF7, MDA-MB-231 is a basal-like breast cancer cell-line, which expresses high levels of endogenous podocalyxin, exhibits poorly polarized monolayer and mammosphere architecture in vitro and forms “metastatic” lung tumors in vivo. Using Podxl-targeted shRNA vectors we show that expression of podocalyxin is required for MDA-MB-231 cells to form distant metastases in a competitive in vivo assay utilizing humanized NOD/SCIDIL-2rγ−/− (NSG) mice. Previously, we observed that Podxl-deficient hematopoietic cells have impaired CXCR4-mediated chemotaxis to CXCL12, a known axis for tumor metastasis. Our current hypothesis is that podocalyxin regulates chemotaxis of tumor-initiating cells (TICs) to the CXCL12-rich tissues of the lungs, liver, and bone marrow. Up-regulation of podocalyxin on breast cancer cells may be a key event in tumor progression and likely enables these cells to sense chemokines and metastasize to peripheral sites. Citation Information: Cancer Res 2012;72(24 Suppl):Abstract nr P1-05-05.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,367 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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