Polymorphism in the Barley Granule Bound Starch Synthase 1 (<i>Gbss1</i>) Gene Associated with Grain Starch Variant Amylose Concentration
Notice bibliographique
Résumé
Granule bound starch synthase 1 (GBSS1) accumulation within starch granules and structure of Gbss1 alleles were determined for nine barley ( Hordeum vulgare L.) genotypes producing amylose-free (undetectable), near-waxy (1.6-4.5%), normal (25.8%), and increased (38.0-40.8%) amylose grain starches. Compared to normal starch granules, GBSS1 accumulation was severely reduced in three near-waxy, slightly reduced in two waxy, and slightly elevated in three increased amylose starches. Gbss1 nucleotide sequence analysis for the nine genotypes distinguished them into three Gbss1 groups with several single-nucleotide polymorphisms. A new unique Q312H substitution within GBSS1 was discovered in near-waxy genotype SB94912 with reduced amylose (1.6%) concentration relative to the other two near-waxy lines, CDC Rattan and CDC Candle (4.5%). The two waxy genotype GBSS1 showed a previously described D287V change for CDC Alamo and a new G513W change for CDC Fibar. Both amino acid alterations are conserved residues within starch synthase domains involved in glucan interaction. The increased amylose genotypes showed several unique nucleotide changes within the second and fourth Gbss1 introns, but only SB94893 GBSS1 showed a unique amino acid substitution, A250T in exon 6. The Gbss1 nucleotide differences were used to design genetic markers to monitor Gbss1 alleles in genotypes with various amylose grain starches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».