In Silico Homology Modeling To Predict Functional Properties of Cruciferin
Notice bibliographique
Résumé
Cruciferin is the major storage protein in Brassicaceae family oilseeds. The predominant cruciferin isoforms in Arabidopsis thaliana were investigated using homology modeling (HM) for their molecular structures and functional properties. The structure of Brassica napus procruciferin was used as the template for HM to determine the molecular structures and hypervariable regions. Hydrophobicity and electrostatic surface potential distribution on the intradisulfide-containing face (IA) and the interdisulfide-containing face (IE) indicated favorable interfacial and solubility properties. More heat-induced structural changes were predicted for the CruC homotrimer than for the CruA or CruB homotrimers. Structural features that facilitate flavor binding and limit proteolytic digestion were more readily observed in CruA and CruB than in CruC. On the basis of these comparative models, structural differences among cruciferin isoforms and their relevance to potential technofunctionalities were identified. This approach of functional property prediction will link protein structure to utilities and will be valuable in designing proteins for targeted applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».