MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2331260218 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-1967

Abstract 1967: Ligand-dependent TGFβ signalling potential

2011· article· en· W2331260218 sur OpenAlexaff
Sarah McLean, John Di Guglielmo

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésR-SMADTransforming growth factorCell biologySMADBiologySignal transductionReceptorCancer researchChemistryTGF alphaGrowth factorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Transforming growth factor beta (TGFβ) is a cytokine which regulates many normal biological processes such as organogenesis and cell cycle control. Its signaling pathway is under intense study as it is commonly dysregulated in pathophysiological conditions such as cancer and fibrosis. The TGFβ signalling cascade is initiated by the binding of ligand to cell-surface serine-threonine kinase receptors. Binding of ligand to the TGFβ receptors initiates phosphorylation of intracellular signalling proteins called Smads, which can then enter the nucleus and initiate specific transcriptional programs. There are three TGFβ ligands which can activate canonical Smad signalling: TGFβ1, TGFβ2 and TGFβ3. These ligands share significant sequence homology (70-80%) but have different spatial and temporal patterns of expression in development. Although TGFβ1 and TGFβ3 are highly expressed in the tumour microenvironment, the role of TGFβ3 has been largely over-looked and thought to be the same as TGFβ1. The objective of the present study is to evaluate the signalling capacity of TGFβ1 and TGFβ3 in non-small cell lung cancer cells. Using dose response studies, we show that TGFβ1 ligand induces Smad2 phosphorylation to a greater extent than TGFβ3. We also show that TGFβ3 induces a lower reduction in steady-state levels of E-cadherin, a protein involved in cell-cell adhesion, compared to TGFβ1. To evaluate the transcriptional programs of both ligands, we used microarray technology to assess gene transcription in non-small cell lung cancer cells treated with TGFβ1 or TGFβ3. Consistent with our signalling data, we found that TGFβ3 induces far fewer genes than TGFβ1. Future studies will evaluate the differential roles of TGFβ1 and TGFβ3 in cancer cell migration and epithelial-to-mesenchymal transition. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 1967. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-1967

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,106

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0320,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetTGF-β signaling in diseasesTravaux en français237 207