Abstract 1967: Ligand-dependent TGFβ signalling potential
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Transforming growth factor beta (TGFβ) is a cytokine which regulates many normal biological processes such as organogenesis and cell cycle control. Its signaling pathway is under intense study as it is commonly dysregulated in pathophysiological conditions such as cancer and fibrosis. The TGFβ signalling cascade is initiated by the binding of ligand to cell-surface serine-threonine kinase receptors. Binding of ligand to the TGFβ receptors initiates phosphorylation of intracellular signalling proteins called Smads, which can then enter the nucleus and initiate specific transcriptional programs. There are three TGFβ ligands which can activate canonical Smad signalling: TGFβ1, TGFβ2 and TGFβ3. These ligands share significant sequence homology (70-80%) but have different spatial and temporal patterns of expression in development. Although TGFβ1 and TGFβ3 are highly expressed in the tumour microenvironment, the role of TGFβ3 has been largely over-looked and thought to be the same as TGFβ1. The objective of the present study is to evaluate the signalling capacity of TGFβ1 and TGFβ3 in non-small cell lung cancer cells. Using dose response studies, we show that TGFβ1 ligand induces Smad2 phosphorylation to a greater extent than TGFβ3. We also show that TGFβ3 induces a lower reduction in steady-state levels of E-cadherin, a protein involved in cell-cell adhesion, compared to TGFβ1. To evaluate the transcriptional programs of both ligands, we used microarray technology to assess gene transcription in non-small cell lung cancer cells treated with TGFβ1 or TGFβ3. Consistent with our signalling data, we found that TGFβ3 induces far fewer genes than TGFβ1. Future studies will evaluate the differential roles of TGFβ1 and TGFβ3 in cancer cell migration and epithelial-to-mesenchymal transition. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 1967. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-1967
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,032 | 0,011 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».