Proteomic Analysis of Human Fetal Atria and Ventricle
Notice bibliographique
Résumé
In this study we carried out a mass spectrometry-based proteome analysis of human fetal atria and ventricles. Heart protein lysates were analyzed on the Q-Exactive mass spectrometer in biological triplicates. Protein identification using MaxQuant yielded a total of 2754 atrial protein groups (91%) and 2825 ventricular protein groups (83%) in at least 2 of the 3 runs with ≥ 2 unique peptides. Statistical analyses using fold-enrichment (>2) and p-values (≤ 0.05) selected chamber-enriched atrial (134) and ventricular (81) protein groups. Several previously characterized cardiac chamber-enriched proteins were identified in this study including atrial isoform of myosin light chain 2 (MYL7), atrial natriuretic peptide (NPPA), connexin 40 (GJA5), and peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase (PAM) for atria, and ventricular isoforms of myosin light chains (MYL2 and MYL3), myosin heavy chain 7 (MYH7), and connexin 43 (GJA1) for ventricle. Our data was compared to in-house generated and publicly available human microarrays, several human cardiac proteomes, and phenotype ontology databases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».