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Enregistrement W2331816454 · doi:10.1097/cji.0b013e31828eed62

Identification of Synthetic Peptides that Inhibit Lipopolysaccharide (LPS) Binding to Myeloid Differentiation Protein-2 (MD-2)

2013· article· en· W2331816454 sur OpenAlex
Hong Yan, Chang-Guo Gu, Faliang Xu, Xiao-Hua Wu, Huahua Yin, Chengxiang Hu, Xudong Zhu, Feng Liu, GE Heng-jiang, Liyong Chen, Xinyan Zhang, Zhengguo Wang, Lei Li

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Immunotherapy · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLipopolysaccharideTLR4PeptidePeptide libraryTumor necrosis factor alphaPhage displayChemistryPeptide sequenceReceptorMolecular biologyBiologyBiochemistryImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many studies have suggested that the synergic effect of myeloid differential protein-2 (MD-2) on bacterial lipopolysaccharide (LPS) stimulation of toll-like receptor 4 (TLR4) may be a critical step during the LPS-TLR4 response signaling pathway. We performed a bioinformatic analysis on the MD-2 protein and identified the amino acid sequence NH2-FSKGKYKCV-COOH (K128-132) as a possible key sequence involved in the binding between MD-2 and LPS. We then screened a random phage display peptide library using this sequence as bait in order to identify antagonistic peptides. After 3 rounds of selection, 3 positive clones were identified. All 3 peptides were shown to inhibit, in a dose-dependent manner the production of tumor necrosis factor-α and interleukin-6 in human U937 and THP-1 cell lines as well as human peripheral blood monocytes stimulated by LPS. Only 2 of the 3 peptides were able to bind MD-2 directly as shown by sulfo-SBED biotin label transfer experiments. BALB/C mice were used to estimate the protection of these peptides from LPS challenge, and 2 of the 3 peptides (Lys-Thr-Val-Pro-Asp-Asn-His and Ile-Gly-Lys-Phe-Leu-Tyr-Arg) reduced mortality of the challenged mice from 100% to 53.8%. This study has demonstrated that interfering with the binding between MD-2 and LPS might be a potential therapeutic strategy for treating LPS-induced sepsis, and in doing so has identified 2 potential peptide candidates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,658

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle