Limited divergence in the spatially subdivided population of the Hawaiian mushroom<i>Rhodocollybia laulaha</i>
Notice bibliographique
Résumé
Here we report the first population genetic examination of a fungus in Hawaii and, to our knowledge, the only investigation of a saprotrophic fungal population distributed across an oceanic archipelago. Rhodocollybia laulaha fruits abundantly in the native rain forests of Hawaii from June through December. Its range includes the geographic extent of the Hawaiian Archipelago; however, this range is highly fragmented because of the discontinuous distribution of the native forest habitat where R. laulaha occurs. We hypothesized that significant patterns of population structure would be recovered within the geographic range of the Hawaiian mushroom R. laulaha resulting from divergence between isolated subpopulations. We tested for population structure and related inferred patterns of restricted gene flow to geographic distance, major geographic features such as mountain peaks and oceans, elevation zones, and spore morphology. We included 120 R. laulaha collections using data from the rRNA IGS1 region, two microsatellite loci, and 184 AFLP loci. Analyses of these genetic data suggest limited genetic structure among R. laulaha subpopulations in Hawaii correlated mostly with geographic distance. Patterns associated with specialization to elevation or spore morphology were not recovered. The limited geographic structure observed in R. laulaha is consistent with relatively recent population fragmentation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».