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Enregistrement W2332171700 · doi:10.1097/pai.0000000000000001

Validation of EP1 Antibody Clone for Estrogen Receptor Immunohistochemistry in Breast Cancer

2014· article· en· W2332171700 sur OpenAlexaff
Caroline Diorio, Sophie Laberge, Chantal Caron, Louise Provencher, Jean‐Charles Hogue, François Sanschagrin

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversité LavalHôpital du Saint-SacrementCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEstrogen receptorclone (Java method)ImmunohistochemistryBreast cancerMedicineAntibodyCancerInternal medicineOncologyEstrogenCancer researchBiologyImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estrogen receptor (ER) tumor's status is critical for breast cancer management. A new rabbit antibody clone, EP1, is now available for ER status determination. The objective was to validate the EP1 antibody clone for its use in breast cancer ER status determination in a clinical setting against the previous standard, SP1. EP1 clone was assessed in 130 consecutive cases, including 50 ER-negative (<1% ER expression), 13 ER-low-positive (1% to 9% ER expression), and 67 ER-positive (≥10% ER expression). Using EP1 versus SP1, positive agreement (sensibility) was 92.5% and negative agreement (specificity) was 100%, leading to an overall agreement of 95.4%. All discordant cases (n=6) were ER-low-positive. SP1 was remeasured in 13 ER-low-positive and in 11 ER-negative cases. Overall agreement between SP1 initial tumor status and reassessment was 70.8% in those negative and low-positive cases. In conclusion, EP1 antibody has been validated for use in breast cancer with a positive agreement ≥90% and a negative agreement ≥95%, as recommended. Also, overall agreement between EP1 and SP1 was as good as between the SP1 initial status and SP1 reassessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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