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Enregistrement W2332325595 · doi:10.2135/cropsci2015.05.0315

Genetic Mapping of Major‐Effect Seed Dormancy Quantitative Trait Loci on Chromosome 2B using Recombinant Substitution Lines in Tetraploid Wheat

2015· article· en· W2332325595 sur OpenAlexaff
Shiaoman Chao, Elias M. Elias, David Benscher, Goro Ishikawa, Yung‐Fen Huang, Mika Saito, Toshiki Nakamura, Steven S. Xu, Justin D. Faris, Mark E. Sorrells

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyQuantitative trait locusInbred strainCultivarPopulationGerminationSeed dormancyDoubled haploidyDormancyAgronomyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Durum wheat ( Triticum turgidum L.) cultivars can benefit from having some level of seed dormancy to help reduce seed damage and lower grain quality caused by preharvest sprouting (PHS) occurring during wet harvesting conditions. Previously, a single chromosome substitution line carrying chromosome 2B of wild emmer [ Triticum turgidum L. subsp. dicoccoides (Körn. ex Asch. & Graebn.) Thell.] in the durum cultivar Langdon background was found to have higher levels of seed dormancy and PHS tolerance. In this study, a population of recombinant substitution lines was developed and used to construct a single nucleotide polymorphism (SNP)‐based high‐density genetic linkage map. Seed germination tests were used to evaluate seed dormancy levels. Multiple interval mapping analysis revealed four quantitative trait loci (QTL) regions affecting seed dormancy. Two regions containing major‐effect QTL contributed by wild emmer were consistently expressed in four environments and explained 5.89 to 11.14% of the phenotypic variation. One QTL region was located near the centromere and the other on the long arm of chromosome 2B in Bayes credible intervals of 4 and 7 cM, respectively. Recombinant inbred lines (RILs) carrying both QTL had an average of 35% reduced rate of germination measured by weighted germination index compared with RILs carrying neither QTL. The two QTL regions identified in this study should be useful for improving PHS tolerance in wheat. Efforts to transfer the two QTL into elite durum cultivars are in progress to examine the effects of genetic background and environment on QTL expression and to evaluate the performance of other agronomic traits in the presence of the QTL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,911
Score d'incertitude au seuil0,187

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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