Vitamin D status and plasma proteomic profiles
Notice bibliographique
Résumé
Vitamin D deficiency, defined as serum 25(OH)D <27.5 nmol/L, has been associated with biomarkers of inflammation and increased risk of type 2 diabetes (T2D) and cardiovascular disease (CVD). Our objective was to examine the association between vitamin D status and a panel of 55 common plasma proteins involved in inflammation, endothelial activation and lipid metabolism in an ethnically diverse population (n=1107) of young Canadian adults aged 20–29 years. Protein concentrations were measured with a tandem mass spectrometry‐based multiple reaction monitoring assay. Using principal components analysis, 4 main independent proteomic profiles were identified. Profiles 1 and 2 each included proteins involved in multiple pathways, while profile 3 consisted of pro‐inflammatory proteins and profile 4 included coagulation proteins. Generalized linear models adjusted for age, sex, BMI, season, ethnicity, physical activity and energy intake showed that vitamin D status was associated with differences in average profile loading scores. Profile 1 was positively associated with vitamin D status, while profiles 2 and 3 were inversely associated with vitamin D status. Vitamin D appears to be associated with distinct plasma proteomic profiles and may regulate physiologic pathways associated with T2D and CVD. Research Support from the Public Health Agency of Canada and the Advanced Foods and Materials Network. Grant Funding Source : Public Health Agency of Canada, Advanced Foods and Materials Network
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».