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Enregistrement W2332452230 · doi:10.1021/la5021669

Dye Lipophilicity and Retention in Lipid Membranes: Implications for Single-Molecule Spectroscopy

2014· article· en· W2332452230 sur OpenAlexafffund
Robert Godin, Hsiao-Wei Liu, Laura J. Smith, Gonzalo Cosa

Notice bibliographique

RevueLangmuir · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular Sensors and Ion Detection
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for Innovation
Mots-clésLipophilicityMembraneChemistryMoleculeSpectroscopyLipid bilayerBiological membraneOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescence studies of individual lipid vesicles rely on the proper positioning of probes in the lipid milieu. This is true for both positional tags and chemoselective fluorogenic probes that undergo chemical modification following reaction with an analyte of interest within the lipid environment. The present report describes lipophilicity and localization estimations for a series of BODIPY dyes bearing substituents of varying hydrophobicity. We also studied fluorogenic trap-reporter probes that undergo fluorescence emission enhancement upon trapping of reactive oxygen species (ROS), including lipid peroxyl radicals. We show that caution has to be taken to extrapolate ensemble partition measurements of dyes to the single-molecule regime as a result of the dramatically different lipid concentration prevailing in ensemble versus single-molecule experiments. We show that the mole fraction of dyes that remains embedded in liposomes during a typical single-molecule experiment may be accurately determined from a ratiometric single-particle imaging analysis. We further demonstrate that fluorescence correlation spectroscopy (FCS) provides a very rapid and reliable estimate of the lipophilic nature of a given dye under highly dilute single-molecule-like conditions. Our combined single-particle spectroscopy and FCS experiments suggest that the minimal mole fraction of membrane-associated dyes (x(m)) as determined from FCS experiments is about 0.5 for adequate dye retention during single-molecule imaging in lipid membranes. Our work further highlights the dramatic effect that chemical modifications can have on chemoselective fluorogenic probe localization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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