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Enregistrement W2332559074 · doi:10.1158/1538-7445.am10-1092

Abstract 1092: Alterations of the retinoblastoma gene in stage III breast cancers

2010· article· en· W2332559074 sur OpenAlexaff
Elisabet O. Berge, Stian Knappskog, Stephanie Geisler, Vidar Staalesen, Pål Puntervoll, Marek Pacal, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Johan R. Lillehaug, Per Eystein Lønning

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPoint mutationRetinoblastomaExonBreast cancerCancerCancer researchGeneGermline mutationMutationGeneticsMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We report the novel finding of point mutations affecting the RB1 gene in breast cancer tissue. Analyzing 73 locally advanced (stage III) breast cancers, we identified two somatic and one germline single nucleotide changes, each leading to amino acid substitution; Leu607Ile, Arg698Trp, and Arg621Cys, respectively. In addition, MLPA analysis revealed two large multiexon deletions (exons 13 to 27 and exons 21 to 23) with the exons 21-23 deletion occurring in the tumor also harboring Leu607Ile. All three RB1 point mutations encoded stable nuclear proteins with impaired ability to induce apoptosis compared to wild-type pRb in vitro. Interestingly, Leu607Ile and Arg621Cys are both located within the spacer region of the protein. Mutations in this part of the RB1 gene have previously been identified in retinoblastoma-prone families. Multiple sequence alignment across species indicates this area to be evolutionary conserved. Notably, three out of four tumors harboring RB1 mutations displayed primary resistance to treatment with either mitomycin or doxorubicin while only 14 out of 64 tumors without mutations were resistant (p = 0.046). Although rare, our findings suggest RB1 mutations to be of biological importance in breast cancer. Note: This abstract was not presented at the AACR 101st Annual Meeting 2010 because the presenter was unable to attend. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 1092.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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