Detection of<i>hssS</i>,<i>hssR</i>,<i>hrtA</i>, and<i>hrtB</i>genes and their expression by hemin in<i>Staphylococcus epidermidis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Staphylococcus aureus employs a heme sensing system (HssR-HssS) and a heme-regulated transporter efflux pump (HrtA-HrtB) to avoid the accumulation of heme, which is toxic at high concentrations. The detoxification system to heme has not been studied in Staphylococcus epidermidis . In this work, the hssR, hssS, hrtA, and hrtB genes were detected, and their expression when stimulated by hemin in S. epidermidis was explored. In silico genomic analyses exhibited that the genetic organization of the hssRS and hrtAB genes was identical in 11 Staphylococcus species analyzed, including S. epidermidis. Slight variations were found in their syntenic regions. The predicted secondary structure of HrtAB proteins from these species was almost identical to these of S. aureus. Additionally, hrtAB promoter sequences of some species were analyzed, and 1 or 2 different nucleotide substitutions were found in the downstream motif. Concentrations of hemin above 5 µmol/L inhibited S. epidermidis growth. However, S. epidermidis that was pre-exposed to a subinhibitory hemin concentration (1 µmol/L) was able to grow when inoculated into medium containing above 5 µmol/L hemin. The expression levels of hrtA and hrtB genes in S. epidermidis exhibited a significant difference when they were stimulated with hemin. Our results suggest that the HrtAB could be involved in hemin detoxification of S. epidermidis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».