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Enregistrement W2332879090 · doi:10.1158/1538-7445.panca2012-b74

Abstract B74: Heterogeneity analysis of hypoxia in surgical samples of pancreatic cancer.

2012· article· en· W2332879090 sur OpenAlexaff
Neesha C. Dhani, Stefano Serra, Joerg Schwock, Jing Xu, Melania Pintilie, Steven Gallinger, Rićhard P. Hill, David W. Hedley

Notice bibliographique

RevueTumor Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPancreatic cancerCancerHypoxia (environmental)MedicineInternal medicineOncologyChemistryOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Tumoral hypoxia (defined as pO2 < 10mmHg) has demonstrated relevance in promoting aggressive tumor biology and treatment resistance. We initiated the PIMO-PANC trial ([NCT01248637][1]) to characterize hypoxia in the tumors of patients (pts) presenting with resectable pancreatic cancer (PaCa) using the exogenous hypoxia marker pimonidazole. This 2-nitroimidazole is reduced at pO2 < 10mmHg, forming adducts detectable by immunostaining. The objective of this analysis was to characterize the intra- and interpatient heterogeneity of tumoral hypoxia. Methods: Eligible pts were those scheduled for surgical resection of PaCa. Enrolled pts received one dose of pimondazole (0.5 gm/m2) intravenously, the day before surgery. Pathology samples of 16 patients accrued were analyzed. Histology was reviewed and > 5 blocks (where available) representing different tumor areas were selected. Serial sections from each tumor block were immunostained for pimonidazole and hematoxylin and eosin (H&E) for histology. Regions for analysis were selected based on H&E-stained sections. Automated image analysis (on Aperio's histology pattern recognition program Genie) was conducted to delineate epithelial and stromal compartments and to quantify hypoxia defined as pimonidazole-positive tumor regions. A qualitative analysis was performed independently. Variance component analysis (VCA) was used to estimate intra/inter-pt heterogeneity. Results: From Nov 2010 to Sept 2011 n=16 patients received pimonidazole. Five did not complete resection due to having advanced/metastatic disease intraoperatively and one common bile duct cancer was excluded; analysis was therefore conducted on ten primary tumors and included 3 to 7 sections per patient tumor. Eight tumors demonstrated a range of hypoxia between 1% and 26% and minimal positive staining was noted (< 5%) in two pts. Hypoxia was detected in both epithelial (range of 1-39%) and stromal (range of 1-13%) compartments. The proportion of the stromal component ranged 38-78%. No correlation between extent of stromal reaction and hypoxia was found. VCA demonstrated the greatest stability in hypoxia in the epithelial tumor compartment (vs. whole tumor or stroma) with a ratio of intratumoral to total variance of 0.21. There was good correlation between qualitative scoring and automated analysis (r = 0.91; p = 0.0003). Conclusions: Pancreatic carcinomas demonstrate a range of hypoxia with greater inter- than intra-pt variability. Our analysis of 10 pts suggests that selecting 2-3 representative sections per pt is adequate to provide a reliable estimate of hypoxia in the epithelial tumor compartment. Our preliminary data suggest that there may be a subset of patient cancers with minimal hypoxia. Citation Format: Neesha C. Dhani, Stefano Serra, Joerg Schwock, Jing Xu, Melania Pintilie, Steven Gallinger, Richard Hill, David W. Hedley. Heterogeneity analysis of hypoxia in surgical samples of pancreatic cancer. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Pancreatic Cancer: Progress and Challenges; Jun 18-21, 2012; Lake Tahoe, NV. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(12 Suppl):Abstract nr B74. [1]: /lookup/external-ref?link_type=CLINTRIALGOV&access_num=NCT01248637&atom=%2Fcanres%2F72%2F14_Supplement%2FB74.atom

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,411
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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