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Enregistrement W2332987544 · doi:10.1139/cjm-2013-0212

Bacterial community changes along a salinity gradient in a Chinese wetland

2013· article· en· W2332987544 sur OpenAlexvenueno aff
Lei Zhang, Guang Gao, Xiangming Tang, Keqiang Shao, Sai Bayartu, Jiangyu Dai

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalinityHalophileBiologyHalotoleranceWetlandTerminal restriction fragment length polymorphismCommunity structureBetaproteobacteriaEcology16S ribosomal RNABotanyRestriction fragment length polymorphismBacteriaActinobacteriaPolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analyzed the composition and diversity of a bacterial community to determine its response to increasing salinity in the Xiangsi Lake wetland in the arid region of northwest China. We studied 12 sites, ranging from freshwater to saltwater habitats, using polymerase chain reaction (PCR)-based terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) and sequencing of the 16S rRNA genes of 5 selected samples. Cluster analysis and phylogenetic analysis revealed that the bacterial community changed significantly in response to increased salinity within the small-scale wetland (50.8 km(2)). Detailed analysis showed that (i) Betaproteobacteria can maintain balanced growth over a salinity range (from 0.34 to 6.86 g/L) through intergenus changes in community structure, followed by a sharp decrease in relative abundance (from 62.2% to 16.0%) when salinity reaches 26.18 g/L; (ii) salt-sensitive and halophobic taxa were progressively replaced by halotolerant and halophilic taxa with increasing salinity; (iii) bacterial diversity was lowest at intermediate salinity levels (6.86 g/L); and (iv) an increasing percentage of unclassified bacterial taxa were found with increasing salinity. This study has implications to improve understanding of bacterial community response to water salinization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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