Substrate Recognition of the Membrane-Associated Sialidase NEU3 Requires a Hydrophobic Aglycone
Notice bibliographique
Résumé
The human neuraminidases (NEU) consist of a family of four isoforms (NEU1-NEU4). Members of this enzyme family are proposed to have important roles in health and disease through regulation of the composition of cellular sialosides. The NEU3 isoform is a membrane-associated enzyme that cleaves glycolipid substrates. However, few reports have examined the substrate specificity of the enzyme for non-natural substrates. We report here a series of 11 synthetic trisaccharides that feature modifications of the aglycone or the Neu5Ac residue of an octyl β-sialyllactoside. The time course of substrate cleavage by NEU3 was monitored using an electrospray ionization mass spectrometry assay to obtain relative rates (k(rel)). We observed that NEU3 substrate activity was directly dependent upon the hydrophobicity of the aglycone but had no apparent requirement for features of the ceramide headgroup. We also observed that trisaccharides with incorporated azide groups in the Neu5Ac residue at either C9 or the N5-Ac position were substrates, and in the case of the N5-azidoacetyl derivative, the activity was superior to that of GM3. However, the incorporation of larger aryl groups was tolerated only at C9, but not at N5-Ac. We propose a two-site model for enzyme recognition, requiring interaction at both the Neu5Ac residue and the hydrophobic aglycone.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».