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Enregistrement W2333364766 · doi:10.3899/jrheum.110130

Relation of HLA-B27, Tumor Necrosis Factor-α Promoter Gene Polymorphisms, and T Cell Cytokine Production in Ankylosing Spondylitis — A Comprehensive Genotype-Phenotype Analysis from an Observational Cohort

2011· article· en· W2333364766 sur OpenAlexvenueno aff
Denis Poddubnyy, E. Märker‐Hermann, Wiebke Kaluza-Schilling, H. Zeidler, Jürgen Braun, Joachim Listing, Joachim Sieper, Martín Rudwaleit

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpondyloarthritis Studies and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésAnkylosing spondylitisMedicineGenotypeTumor necrosis factor alphaImmunologyCytokineSpondylitisPhenotypeHuman leukocyte antigenGeneHLA-B27GeneticsBiologyAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: In a pilot study, a distinct T cell cytokine pattern associated with HLA-B27 status and a tumor necrosis factor-α (TNF-α) promoter gene polymorphism was found at -308 (TNF-308). The objective of our study was to assess these associations in a different cohort of patients with ankylosing spondylitis (AS) and to evaluate any effect on clinical measurements. METHODS: Peripheral T cell cytokine production of patients with AS (n = 121) from the German Spondyloarthritis Inception Cohort was assessed by flow cytometry and correlated with HLA-B27, TNF-238, and TNF-308, and with clinical measurements. RESULTS: In HLA-B27-positive, anti-TNF-naive patients with AS, the percentages of TNF-α-producing (5.02%) and interleukin 10-producing (0.31%) CD8+ cells were significantly lower in comparison to HLA-B27-negative patients (9.52%, p = 0.048, and 0.46%, p = 0.037, respectively). A nonsignificant trend was found for a lower production of TNF-α by CD4+ and interferon-γ by both CD4+ and CD8+ T cells, as compared to HLA-B27-negative patients with AS (p > 0.05 for all comparisons). The A allele at TNF-308 was associated with a lower percentage of TNF-α-producing CD4+ T cells. No significant correlations were found between clinical or radiological measurements and cytokine production or with TNF-α promoter gene polymorphisms. CONCLUSION: Modulation of T cell cytokines by HLA-B27 might play a role in AS pathogenesis in B27-positive individuals. No conclusive data were obtained for the TNF-308 polymorphism on cytokine production, and no effect of cytokines or genetic polymorphisms on clinical manifestations was observed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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