MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2334201693 · doi:10.1097/qad.0000000000000249

Modified interferon-α subtypes production and chemokine networks in the thymus during acute simian immunodeficiency virus infection, impact on thymopoiesis

2014· article· en· W2334201693 sur OpenAlexaff
Jacques Dutrieux, Véronique Fabre-Mersseman, Bénédicte Charmeteau-De Muylder, Magali Rancez, Rosalie Ponte, Sandra Rozlan, Suzanne Figueiredo-Morgado, Amandine Bernard, Stéphanie Beq, Anne Couëdel-Courteille, Rémi Cheynier

Notice bibliographique

RevueAIDS · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologySimian immunodeficiency virusThymocyteChemokineImmunologyFlow cytometryImmunodeficiencyInterferonVirusImmune systemLymphopoiesisVirologyT cellCell biologyHaematopoiesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Thymus dysfunction characterizes human/simian immunodeficiency virus (SIV) infections and contributes to physiopathology. However, both the mechanisms involved in thymic dysfunction and its precise timing remain unknown. We here analyzed thymic function during acute SIV infection in rhesus macaques. DESIGN AND METHODS: Rhesus macaques were intravenously infected with SIVmac251 and bled every 2/3 days or necropsied at different early time points postinfection. Naive T-cell counts were followed by flow cytometry and their T-cell receptor excision circle content evaluated by qPCR. Thymic chemokines were quantified by reverse transcription-qPCR and localized by in-situ hybridization in thymuses collected at necropsy. Thymic interferon alpha (IFN-α) subtype production was quantified by reverse transcription-qPCR combined to heteroduplex tracking assay. The effect of thymic IFN-α subtypes was tested on sorted triple negative thymocytes cultured on OP9-hDL1 cells. RESULTS: A reduced intrathymic proliferation history characterizes T cells produced during the first weeks of infection. Moreover, we evidenced a profound alteration of both chemokines and IFN-α subtypes transcriptional patterns in SIV-infected thymuses. Finally, we showed that IFN-α subtypes produced in the infected thymuses inhibit thymocyte proliferation, still preserving their differentiation capacity. CONCLUSION: Thymopoiesis is deeply impacted from the first days of SIV infection. Reduced thymocyte proliferation - a time-consuming process - together with modified chemokine networks is consistent with thymocyte differentiation speed-up. This may transiently enhance thymic output, thus increasing naive T-cell counts and diversity and the immune competence of the host. Nonetheless, long-lasting modification of thymic physiology may lead to thymic exhaustion, as observed in late primary HIV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAIDSMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207