Recombinant Phenotyping of Cytomegalovirus Sequence Variants Detected After 200 or 100 Days of Valganciclovir Prophylaxis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: In a phase III controlled trial IMproved Protection Against Cytomegalovirus in Transplantation (IMPACT) comparing 200 with 100 days of valganciclovir prophylaxis in 318 cytomegalovirus D+/R- kidney transplant recipients, an equal number of patients (n=3 per arm) had known ganciclovir resistance mutations detected during viral breakthrough. In addition, many other viral sequence variants were observed that were of unknown significance for ganciclovir resistance. Recombinant phenotyping was performed to determine whether the previously uncharacterized genotypic changes affected ganciclovir susceptibility, especially in those receiving the longer duration of prophylaxis. METHODS: Sequences encoding individual amino acid substitutions in the UL97 kinase or UL54 DNA polymerase gene were transferred by recombination into a cloned cytomegalovirus laboratory strain, followed by reporter-based yield reduction phenotypic assay of the resulting virus for ganciclovir susceptibility. RESULTS: Twenty-six uncharacterized amino acid substitutions were detected, 2 in UL97 and 24 in UL54. All 10 substitutions in the 200-day arm and 9 of 17 substitutions in the 100-day arm (prioritized based on location and conservation) were selected for phenotyping; one substitution was detected in both subsets. Results were generated for nine of ten 200-day and eight of nine 100-day substitutions, with no substitution demonstrating a significant reduction in ganciclovir susceptibility. The two remaining amino acid substitutions, both in UL54, were not evaluated because of poor viral viability. CONCLUSION: Phenotypic evaluation of previously uncharacterized viral genotypes in the 200-day valganciclovir prophylaxis group showed no evidence of an increased incidence of genotypic ganciclovir resistance when compared with those in the 100-day prophylaxis group.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».