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Enregistrement W2334893168 · doi:10.1021/jp300011k

Direct Imaging of Hydrogen Bond Formation in Dissociative Adsorption of Glycine on Si(111)7×7 by Scanning Tunneling Microscopy

2012· article· en· W2334893168 sur OpenAlexaff
Avisek Chatterjee, L. Zhang, K. T. Leung

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry C · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMolecular Junctions and Nanostructures
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScanning tunneling microscopeChemistryDimerCrystallographyHydrogenHydrogen bondMoleculeCluster (spacecraft)AdsorptionHydrogen atomChemical physicsMaterials scienceNanotechnologyPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adsorption of glycine on a Si(111)7×7 surface at room temperature has been studied by scanning tunneling microscopy (STM). The observed STM images provide strong evidence for dissociative adsorption of glycine through N–H bond cleavage (and N–Si bond formation) as reported in our recent X-ray photoemission study. In particular, the dissociated H atom is found to anchor on a restatom while the N–H dissociated glycine molecule adsorbs on an adatom in a tilted, unidentate geometry. STM study for higher exposures further reveals that the second adlayer is mediated by vertical hydrogen bonding, in excellent accord with our recent X-ray photoemission results. In addition to this vertical hydrogen bonding between a glycine molecule and the N–H dissociated glycine adsorbate, we also observe horizontal hydrogen bonding, not seen before, between two N–H dissociated glycine adsorbates at two neighboring adatom sites. These hydrogen-bonded adstructures, as implicated in the STM images, have been corroborated with our computational DFT/B3LYP/6-31++(d,p) results by using the two largest model surfaces: a Si 16 H 18 cluster to simulate an adatom–restatom pair and a Si 26 H 24 cluster to model a double adatom–adatom pair across the dimer wall of the 7×7 surface. Furthermore, statistical analysis of the STM images for different exposures shows that the center adatom is more reactive than the corner adatom and that the faulted half is more reactive than the unfaulted half. The horizontal hydrogen bonding appears to be favored at a lower exposure than the vertical hydrogen bonding, which becomes dominant at a higher exposure as formation of the second adlayer proceeds. The present work illustrates the importance of hydrogen bonding in the early growth and site-specific chemistry of glycine on Si(111)7×7 surfaces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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