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Enregistrement W2334942916 · doi:10.1021/bi101972y

Interactions between Kinase Scaffold MP1/p14 and Its Endosomal Anchoring Protein p18

2011· article· en· W2334942916 sur OpenAlexaff
James E. Magee, Mirosław Cygler

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScaffold proteinEndosomeAnchoringScaffoldCell biologyChemistryProtein kinase AKinaseSignal transductionBiologyComputer sciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Scaffold and adaptor proteins provide means for the spatial organization of signaling cascades. MP1 is a scaffold protein in the RAF/MEK/ERK pathway and together with p14 forms a heterodimer that was shown to be responsible for localization of MEK to the late endosomal compartment. However, the mechanism by which MP1/p14 tethers MEK to the endosomal membrane was not resolved. Recently, an adaptor protein p18 was identified as a binding partner of MP1/p14. p18 is attached to the endosomal surface by myristoyl and palmitoyl groups located at the N-terminus of the protein and tethers the signaling complex to the cytoplasmic surface of late endosomes. p18 expressed in E. coli is retained in inclusion bodies, and we developed a protocol to refold it from the denatured state. Coexpression of p18 with MP1/p14 leads to a soluble protein complex. We examined the interaction of p18 with the MP1/p14 constitutive heterodimer. We cloned various constructs of p18 and characterized their behavior and interactions with MP1/p14 in vitro using SEC and pull-down assays. We determined that the refolded p18 is a monomer in solution with molten globule characteristics. Its binding to MP1/p14 promotes folding and ordering. We also identified a proteolytically stable fragment of p18 and showed that it binds to MP1/p14 with similar affinity to the full-length construct and determined an apparent dissociation constant in the low micromolar range for the interaction. Finally, we show that the ∼60 C-terminal residues of p18 are not required for in vitro interaction with MP1/p14 heterodimer, in contrast to previously reported findings showing that truncation of 41 C-terminal residues of p18 prevents endosomal localization of MP1/p14.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,726

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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