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Enregistrement W2334998682 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-lb-179

Abstract LB-179: The effects of hypoxia and reactive oxygen species on the methylation status of the polo-like kinases

2011· article· en· W2334998682 sur OpenAlexaff
Alejandra Ward, John W. Hudson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolo-like kinaseBiologyPLK1DNA methylationEpigeneticsMethylationCytokinesisKinaseMitosisCarcinogenesisCell biologyCancer researchMolecular biologyCell cycleCell divisionGeneticsCellCancerGene expressionDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The family of polo-like kinases (Plks) consisting of five known members are key regulators of important cell cycle processes, such as mitotic entry, centrosome duplication, spindle assembly, and cytokinesis. Plk1 is typically overexpressed in many cancers, while Plks 2–4 deregulation is often associated with tumorigenesis and malignancy. Plk2 has been shown to be downregulated via promoter DNA hypermethylation in blood neoplasms. Furthermore, in hepatocellular carcinoma (HCC), we and others have shown Plks 2–4 are downregulated through epigenetic modifications, while concurrent decreased Plk 1 promoter methylation was correlated with increased expression. As changes in epigenetic modifications have been associated with external environmental stimuli, we hypothesized that the Plks may be important targets whose disregulation could contribute to malignancy. We therefore examined the status of promoter methylation and expression levels of the Plk family members under hypoxic conditions, and upon exposure to reactive oxygen species (ROS). Interestingly both wild-type and Plk4 heterozygous murine embryonic fibroblasts (MEFs) exposed to ROS displayed significant promoter methylation post treatment. Correspondingly, Plk4 transcript levels were reduced to 90% with no detectable Plk4 protein after exposure to ROS. Since ROS and hypoxic conditions are associated with liver function and normal metabolism, we next examined the promoter methylation status for the individual Plks and other markers in HepG2 and Hep3B liver cell lines. We found increased hypermethylation of the promoter region as well as decreased transcripts levels for both Plk1 and Plk4 post ROS treatment in both cell lines. No detectable methylation changes were detected in SAOS (bone sarcoma, p53 null) cells, while U2OS (p53 wild type) displayed increased methylation and decreased transcript levels. This suggests that the response to ROS might be dependent upon p53 status and origin of cell line. Similar to the case with ROS, hypoxia treatment also induced hypermethylation of Plk4 and decreased in transcripts in both HepG2 and Hep3B cells, while Plk1 levels were only reduced in HepG2 cells. Our results suggest that changes in the cellular environment may be a key regulator of Plk methylation status that in turn leads to deregulation. This has important implications in HCC and other cancers, where these epigenetic alterations could be contributing factors in tumourigenesis and disease progression. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr LB-179. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-LB-179

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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