Mechanistic role of the catalytic residue D300 in human pancreatic alpha-amylase
Notice bibliographique
Résumé
Carbonic anhydrase (CA) plays important roles in biological processes such as photosynthesis, respiration, secretion of HCO3 -, pH homeostasis and ion exchange. The proteins commonly contain a zinc ion in the active site for catalyzing the hydration of CO2 and vice versa. It is known that there are three classes of CA, designated -, and -CAs, depending on the amino acid sequence similarities. The -class is different from others in the structural architecture. Furthermore, even in the -class, the enzyme from unicellular green alga, Chlamydomonas reinhardtii (chCA) is unique in posttranslational modifications that it is glycosylated and spliced into two peptides. Such glycosylations are found in only mammalian CAs but they are not spliced. To reveal the structural details and the role of N-glycosylation, an X-ray analysis of chCA has been performed. chCA is a homodimeric protein, the two subunits being crystallographically independent. In each subunit, residues from Ser298 to Asn345 are spliced to separate into long and short peptides. The two subunits are, however, linked together by a disulfide bond. In the catalytic site, a zinc ion is bound to the three conserved His163, His165 and His182 in a tetrahedral configuration. A water molecule is trapped at the fourth position of the Zn atom. The electron density maps indicate that N-glycosylations occur at the three sites, Asn101, Asn135 and Asn297. This structure is the first example of CA attached to N-glycosides. chCA molecules are interacted to each other with a six-fold screw symmetry to form a long column. Furthermore, they are fused through the lateral interactions like a beehive. Each catalytic site is exposed to the central tunnel. It suggests that chCA in the crystalline state also catalyze the reaction.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».