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Enregistrement W2335111169 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-320

Abstract 320: Association of higher Gleason grade with presence of PTEN deletion in prostatic adenocarcinoma

2011· article· en· W2335111169 sur OpenAlexaff
Maisa Yoshimoto, Andrew Evans, Joan Sweet, Olga Ludkovski, Keyue Ding, Greg Trottier, Kyu Sang Song, Jeremy A. Squire

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreRobarts Clinical TrialsUniversity Health NetworkQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENTMPRSS2Prostate cancerCancer researchFluorescence in situ hybridizationProstateTissue microarrayAdenocarcinomaFusion geneGrading (engineering)CancerPathologyBiologyMedicineImmunohistochemistryOncologyGeneChromosomeInternal medicineGeneticsDiseasePI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prostatic adenocarcinoma (CaP) is one of the most histologically heterogeneous of epithelial malignancies. The Gleason score is widely accepted as the standard for histologic grading and determining prognosis of prostate malignancies. The tumor often presents with a multifocal distribution though the gland and different Gleason grades may be present in different foci. The current study was undertaken to compare the association of genomic alterations with the Gleason grades of individual adenocarcinoma foci. Genomic deletion of the PTEN gene in routine formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) pathology sections can be readily assayed by fluorescence in situ hybridization (FISH). Data from our group and others has shown that the genomic deletion of the PTEN tumor suppressor gene and the disruption of the ETS gene family, play a central role in prostate cancer and are likely to be associated with Gleason grade. In this study CaP samples were thoroughly analyzed to identify PTEN heterogeneity, within or between foci in multifocal tumors. This study was designed to retrospectively assess the overall frequency with which PTEN deletions and TMPRSS2-ERG fusion rearrangements occur individually and simultaneously, and their clinical impact through FISH analysis using well-annotated high-throughput tissue microarrays (TMAs) derived from 128 patients with CaP. In addition, four-color FISH analysis of the PTEN deletion was used to precisely detect the interstitial deletion of genomic content from this region of chromosome 10q and evaluate the tumor heterogeneity. Genomic PTEN deletion was observed in 55 of 128 (43%) patients with CaP (hemizygous = 41 and homozygous = 14 CaP). TMPRSS2-ERG fusion was observed in 58 of 129 (45%). We specifically examined the relationship between PTEN deletion and TMPRSS2-ERG fusion status, Gleason pattern and clinical behavior of CaP. Importantly, PTEN deletions were significantly associated with a higher primary Gleason pattern grade 4 (p=0.000), lymphovascular invasion (p=0.051), and higher percentage of prostate involved by tumor (p=0.0064). Although TMPRSS2-ERG fusions showed a strong relationship with PTEN deletions (p=0.007), TMPRSS2-ERG fusions did not show any clinical correlation. In conclusion, our findings indicated that PTEN deletion FISH can be applied to CaP samples to accurately stratify patients into risk categories and to guide decision-making with respect to the optimal management of CaP patients. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 320. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-320

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,114
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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