Nontargeted Comprehensive Two-Dimensional Gas Chromatography/Time-of-Flight Mass Spectrometry Method and Software for Inventorying Persistent and Bioaccumulative Contaminants in Marine Environments
Notice bibliographique
Résumé
Analytical methods for contaminant monitoring are generally targeted; i.e., they measure defined lists of compounds. Routine monitoring projects using targeted methods are not usually designed to screen for unrecognized or novel contaminants and therefore miss compounds within the region or population of study that cause, or have the potential to cause, adverse biological impacts. We describe a nontargeted analytical method utilizing direct sample introduction coupled to comprehensive two-dimensional gas chromatography with time-of-flight mass spectrometry. To test the capabilities of this instrumental method within the context of marine contaminant surveys, we characterized a broad array of nonpolar, persistent, and bioaccumulative contaminants in Atlantic common dolphin ( Delphinus delphis ) blubber, including compounds that are not typically monitored. Compound identifications were made by searching a standard reference database, by contemporaneously analyzing mass spectra from reference standards, and by de novo interpretation. We identified a total of 271 compounds belonging to 24 classes; all compounds but 1 were halogenated. Anthropogenic contaminants and halogenated natural products were concurrently detected. A total of 86 compounds were anthropogenic contaminants that are not routinely targeted in environmental surveys, and 54 compounds were halogenated natural products. A total of 112 spectra were identified de novo, demonstrating that exclusive reliance on commercially available reference standards and mass spectral libraries may miss a significant fraction of identifiable compounds. We also cataloged 27 halogenated mass spectra that were not able to be identified. Due to the volume and complexity of the identification data, we developed custom software to organize and provide shared access to the identified mass spectra and related information. The nontargeted analytical method and data reporting system, in combination with the analysis of a high-trophic-level sentinel species, demonstrates a framework for creating an inventory of persistent and bioaccumulative contaminants in marine environments, with the future goal of suggesting new compounds for further investigation by targeted monitoring and risk assessment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».