Crystal structure of the full-length sorbitol operon regulator SorC from<i>Klebsiella pneumoniae</i>: structural evidence for a novel transcriptional regulation mechanism
Notice bibliographique
Résumé
Parasitic nematodes cause serious diseases in humans and animals, economically impacting agricultural industries. Chemoprophylaxis offers short-term benefits, but due to rapid development of drug resistance in parasites there is a pressing need for novel treatments of nematode infections. Lipid binding proteins (LBPs) play an important role in parasitic nematode's limited lipid metabolism. Several structurally novel families of LBPs in nematodes have been described, including the fatty acid and retinoid binding protein family (FAR). In C. elegans, used as a model for studying parasitic nematodes, eight Ce-FAR proteins have been described. Here we report the first high resolution structure of a FAR protein -the 1.8 crystal structure of Ce-FAR-7. Ce-FAR-7 has nine helices, packed into a novel fold containing two hydrophobic binding pockets. Pocket P1 can accommodate fatty acids with different length of the aliphatic chain, whereas P2 is more suitable for bulkier ligands like retinoids and other signaling lipids. Our results suggest that retinol binding can be upregulated by casein kinase 2, via phosphorylation of Thr26 positioned at the bottom of the pocket P2. GFP localization in vivo shows, that Ce-FAR-7 is intracellular and present in all development stages of the nematode. It is mainly localized in the excretory cell and head hypodermis region of the worm. However, during starvation its localization changes and Ce-FAR-7 is expressed in the body hypodermis. In conclusion, our study provides the basic structural and functional information for investigation of inhibitors of lipid binding by FAR proteins, which could result in new generation of anti-nematode drugs.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».