Effect of antiretroviral therapy on HIV-1 genetic evolution during acute infection
Notice bibliographique
Résumé
The rapid evolution of HIV-1 is a major obstacle to viral eradication. Early antiretroviral therapy (ART) during primary HIV-1 infection could limit viral diversity. Eighteen patients recently infected with HIV-1 were selected. Nine initiated ART soon after enrolment and nine remained untreated. Replication-competent (RC) viruses were quantified at baseline and after one year of follow-up. Viral diversity in the C2V5 envelope region was evaluated from plasma, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), and cell culture at both time points. The amount of RC virus in the treated group declined (median -5.42 infectious units per million [IUPM]) while it remained stable or increased in the untreated group (median +0.87 IUPM). At one year post infection, we observed a significant increase in diversity for the C2V5 (+0.150%) region, specifically in the hypervariable loops V4 (+0.73%) and V5 (+0.77%), in the untreated group. More importantly, viral diversity did not significantly increase in treated individuals during the first year post infection. Genetic diversity during primary infection remains low through the first year of infection. Early treatment could contribute to a decrease in RC viruses from PBMCs and to limitation of viral diversification in the viral reservoir. These findings may have relevance for the rational design of specific immunotherapeutic strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».