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Enregistrement W2335653881 · doi:10.1139/w11-071

Autoactivated<i>KlPDR1</i>gene in the control of multidrug resistance in<i>Kluyveromyces lactis</i>

2011· article· en· W2335653881 sur OpenAlexvenueno aff
Nora Tóth Hervay, Zuzana Hodurova, Zuzana Balazfyova, Yvetta Gbelská

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundLIFE programme
Mots-clésKluyveromyces lactisGeneBiologyEffluxMutantPlasmidPromoterGene expressionGeneticsKluyveromycesMultiple drug resistanceATP-binding cassette transporterMolecular biologyDrug resistanceTransporterSaccharomyces cerevisiae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The KlPDR1 gene encodes a zinc finger transcription factor that has recently been shown to be involved in the control of multidrug resistance of Kluyveromyces lactis . In this work, we provide evidence that the K. lactis KlPDR1 gene is under positive autoregulation by KlPdr1p, which plays a role in the activation of the main multidrug resistance transporter gene KlPDR5. Electrophoretic mobility shift assays, as well as the use of gusA reporter constructs, enabled us to identify the 5'-tataTCCGGGTAactt-3' sequence motif in the KlPDR1 promoter (in the position -326 to -319 bp) as the PDRE (pleiotropic drug responsive element) for the binding of KlPdr1p. The drug sensitivity of Klpdr1Δ mutant cells was complemented by introducing the plasmid-born KlPDR1 gene. The KlPdr1p activated the expression of the P(KlPDR1)-gusA fusion gene, and the expression of the KlPDR1 gene was induced by fluconazole. The PDRE was also found in the promoter of KlPDR5, a gene encoding the ATP-dependent efflux pump responsible for the drug resistance phenomenon in K. lactis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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