Adjunctive HPV In-Situ Hybridization (ISH) Assay as an Aid in the Diagnosis of Cervical Intraepithelial Neoplasia in Cervical Tissue Specimens
Notice bibliographique
Résumé
The purpose of this study was to develop and analytically and functionally validate a new human papillomavirus (HPV) in-situ hybridization (ISH) assay and to determine whether the use of this assay combined with hemotoxylin and eosin (H&E) staining could potentially improve the diagnostic accuracy of interpreting cervical intraepithelial neoplasia (CIN) in human cervical tissue specimens. An automated HPV ISH assay was developed using probes that targeted the broad spectrum of HPV genotypes most commonly associated with CIN. In an exploratory study, tissue sections (n=118) were stained with H&E alone and H&E with HPV ISH and evaluated by 6 general surgical pathologists. Results were compared with diagnoses established by expert pathologists on H&E alone. The change in specificity (diagnosis of no-CIN) and sensitivity (diagnosis of CIN) using H&E plus HPV versus H&E alone was determined. The HPV ISH assay detected 21 HPV genotypes and demonstrated no cross-reactivity to Epstein-Barr virus, cytomegalovirus, herpes simplex virus (HSV)-1, HSV-2, or human placental DNA. The assay detected HPV in a range of 1 to 600 copies on CaSki, HeLa, and SiHa xenografts. Use of this assay with H&E staining improved the average diagnostic specificity of the surgical pathologists from 68.5% to 89.9% (P<0.001), with fewer false-positive CIN 1 results (122 vs. 39). The diagnostic sensitivity was similar for assessments made with H&E alone and those made with HPV plus H&E (93.1% vs. 93.6%). In conclusion, a new automated broad-spectrum HPV ISH assay combined with H&E-stained slides contributed to better ascertainment of CIN than H&E staining alone.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».