Initial Excited-State Structural Dynamics of 6-Substituted Uracil Derivatives: Femtosecond Angle and Bond Lengthening Dynamics in Pyrimidine Nucleobase Photochemistry
Notice bibliographique
Résumé
Substituents on the pyrimidine ring of nucleobases appear to play a major role in determining their initial excited-state structural dynamics and resulting photochemistry. To better understand the determinants of nucleobase initial excited-state structural dynamics, we have measured the absorption and resonance Raman excitation profiles of 6-deuterouracil (6-d-U) and 6-methyluracil (6-MeU). Simulation of the resonance Raman excitation profiles and absorption spectrum with a self-consistent, time-dependent formalism shows the effect of the deuterium and methyl group on the photochemically active internal coordinates, i.e. C5C6 stretch and C5X and C6X bends. The methyl group on either the C5 or C6 position of uracil equally increases the excited-state reorganization energies along the C5C6 stretch. However, a lower reorganization energy of the C5X + C6X bends in 6-MeU than uracil and 5-MeU shows that C6 methyl substituents reduce the bending reorganization energy. In addition, deuterium substitution at either C5 or C6 has a much smaller effect on the initial excited-state structural dynamics than methyl substitution, consistent with a mass effect. These results will be discussed in light of the resulting photochemistry of pyrimidine nucleobases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».