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Enregistrement W2335968448 · doi:10.1002/2015jg003233

Exploring the metabolic potential of microbial communities in ultra‐basic, reducing springs at The Cedars, CA, USA: Experimental evidence of microbial methanogenesis and heterotrophic acetogenesis

2016· article· en· W2335968448 sur OpenAlexaff
Lukas Kohl, Emily A. Cumming, Alison Cox, Amanda Rietze, Liam S. Morrissey, Susan Q. Lang, Andreas Richter, Shino Suzuki, Kenneth H. Nealson, Penny L. Morrill

Notice bibliographique

RevueJournal of Geophysical Research Biogeosciences · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcetogenesisMethanogenesisEnvironmental chemistryMethaneChemistryFormateAbiogenic petroleum originMicrobial consortiumHeterotrophBiochemistryOrganic chemistryGeologyMicroorganismBacteriaCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Present‐day serpentinization generates groundwaters with conditions (pH > 11, Eh < −550 mV) favorable for the microbial and abiotic production of organic compounds from inorganic precursors. Elevated concentrations of methane, C 2 ‐C 6 alkanes, acetate, and formate have been detected at these sites, but the microbial or abiotic origin of these compounds remains unclear. While geochemical data indicate that methane at most sites of present‐day serpentinization is abiogenic, the stable carbon, hydrogen, and clumped isotope data as well as the hydrocarbon gas composition from The Cedars, CA, USA, are consistent with a microbial origin for methane. However, there is no direct evidence of methanogenesis at this site of serpentinization. We report on laboratory experiments in which the microbial communities in fluids and sediments from The Cedars were incubated with 13 C labeled substrates. Increasing methane concentrations and the incorporation of 13 C into methane in live experiments, but not in killed controls, demonstrated that methanogens converted methanol, formate, acetate (methyl group), and bicarbonate to methane. The apparent fractionation between methane and potential substrates ( α 13 C CH4‐CO2(g) = 1.059 to 1.105, α 13 C CH4‐acetate = 1.042 to 1.119) indicated that methanogenesis was dominated by the carbonate reduction pathway. Increasing concentrations of volatile organic acid anions indicated microbial acetogenesis. α 13 C CO2(g)‐acetate values (0.999 to 1.000), however, were inconsistent with autotrophic acetogenesis, thus suggesting that acetate was produced through fermentation. This is the first study to show direct evidence of microbial methanogenesis and acetogenesis by the native microbial community at a site of present‐day serpentinization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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