Go West: A One Way Stepping-Stone Dispersion Model for the Cavefish Lucifuga dentata in Western Cuba
Notice bibliographique
Résumé
Consistent with the limited dispersal capacity of most troglobitic animals, almost all Lucifuga cavefish species have very narrow geographic distribution in Cuba. However, one species, L. dentata, has a wide but disjointed distribution over 300 km in the west of the island. In order to estimate the relative role of vicariance and dispersal in the unexpected L. dentata distribution, we obtained partial sequences of the mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome b (cytb) gene and control region (CR), and then applied Approximate Bayesian Computation (ABC), based on the identification of five genetic and geographic congruent groups of populations. The process that best explains the distribution of genetic diversity in this species is sequential range expansion from east Matanzas to the western Pinar del Río provinces, followed by isolation of groups of populations. We found relative high haplotype diversity and low nucleotide diversity in all but the Havana group, which has high values for both diversity parameters, suggesting that this group has been demographically stable over time. For two groups of populations (Cayuco and Bolondrón), the mismatch distribution analyses suggests past demographic expansion. In the case of the Cayuco region, the star like relationships of haplotypes in the network suggests a recent founding event, congruent with other evidence indicating that this is the most recently colonized region. Over all, the results suggest that a combination of habitat availability, temporal interconnections, and possibly the biological properties of this species, may have enabled its dispersal and range expansion compared to other species of the genus, which are more geographically restricted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».