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Enregistrement W2336354963 · doi:10.1186/1753-6561-9-s9-p49

Characterization of Alternative Promoters to Stagger and Control Protein Expression in the Baculovirus-Insect Cell System: From Intracellular Reporter Proteins to Fluorescent Influenza Virus-like Particles

2015· article· en· W2336354963 sur OpenAlexafffundabout
Steve George, Marc G. Aucoin

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGreen fluorescent proteinIntracellularVirusCell biologyBaculoviridaeReporter geneCharacterization (materials science)VirologyFluorescenceFluorescent proteinBiologyGene expressionGeneNanotechnologyBiochemistryMaterials scienceRecombinant DNASpodopteraPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The Baculovirus Expression Vector System (BEVS) is increasingly used for protein production in both industry and academia, and much work has been conducted to improve this system. The baculovirus infection of an insect cell sets up a sophisticated and complex series of gene expression events that are very tightly temporally regulated. The study of this system has progressed to such an extent that many control elements, such as activators, enhancers, and promoters involved in this process have been discovered and characterized to some extent, as reviewed in [1]. These control elements can be used to regulate the expression of heterologous genes, in order to move beyond “brute force” expression of large amounts of protein within insect cells. It enables researchers to set up a pre-planned series of expression events of multiple genes within one cell, and to essentially “program” gene expression by modifying the baculovirus genome. While some groups have investigated this, a systematic study of control elements and how expression from a single gene affects expression from other heterologous genes, has not been conducted thus far. This study characterizes gene expression from several baculovirus promoters for the production of proteins and virus-like particles, and examines interaction effects when promoters drive expression of genes at different times and at different levels. Materials and Methods Two sets of protein coding genes were investigated. Both sets of constructs were arranged such that one gene was always under the control of the very strong polyhedron (polh) promoter, while the other gene was under the control of the early ie1, late basic, gp64orvcath, or the very late p10 promoters. The first set of proteins examined consisted of two easily traceable fluorescent proteins requiring minimal post-translational processing: the enhanced green fluorescent protein (eGFP, herein referred to as GFP) and a red fluorescent protein (DsRed2 herein referred to as RFP). The RFP gene was always under the control of the polh promoter while GFP was placed downstream of one of the other five promoters [2].The second set of proteins studied were fusions of influenza A virus proteins. More specifically, human influenza A/PR/8/34 hemagglutinin (HA) and matrix (M1) proteins were fused to eGFP(HAGFP) and DsRed2 (M1RFP) respectively. The M1RFP gene was always under the control of the polh promoter while HAGFP was placed downstream of one of the other five promoters. Sf9 cells were infected at a cell density of 1 × 106 cells/mL and at a multiplicity of infection of 5. Cells were examined by light and fluorescence microscopy, as well as by flow cytometry. Virus-like particles were recovered from infected cell culture supernatants by subjecting the supernatants to iodixanol gradient ultracentrifugation as previously described in [3]. Virus-like particles were characterized by flow cytometry using a method similar to that described in [4],by negative stain * Correspondence: marc.aucoin@uwaterloo.ca Department of Chemical Engineering, University of Waterloo, Waterloo, Ontario, N2L3G1, Canada George and Aucoin BMC Proceedings 2015, 9(Suppl 9):P49 http://www.biomedcentral.com/1753-6561/9/S9/P49

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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