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Enregistrement W2336666739 · doi:10.1038/srep24667

NLRP3 Localizes to the Tubular Epithelium in Human Kidney and Correlates With Outcome in IgA Nephropathy

2016· article· en· W2336666739 sur OpenAlexafffund
Justin Chun, Hyunjae Chung, Xiangyu Wang, Rebecca Barry, Zohreh Mohammad Taheri, Jaye M. Platnich, Sofia B. Ahmed, Kiril Trpkov, Brenda R. Hemmelgarn, Hallgrímur Benediktsson, Matthew T. James, Daniel A. Muruve

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesKidney Foundation of Canada
Mots-clésKidneyNephropathyPathogenesisKidney diseasePathologyGlomerulonephritisImmunohistochemistryAcute kidney injuryMedicineTamm–Horsfall proteinImmunofluorescenceBiologyInternal medicineEndocrinologyImmunologyAntibodyDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nod-like receptor pyrin domain-containing-3 (NLRP3) has been implicated in the pathogenesis of experimental renal injury, yet its characterization in human kidney disease remains largely unexplored. NLRP3 expression was evaluated in human kidney biopsies, primary renal tubular cells (HPTC) and correlated to disease outcomes in patients with IgA nephropathy (IgAN). NLRP3 localized to renal tubules in normal human kidney tissue and to mitochondria within HPTC by immunohistochemistry and immunofluorescence microscopy. Compared to control kidneys, NLRP3 gene expression was increased in biopsies of patients with IgAN. While NLRP3 expression in IgAN was detected in glomeruli, it remained largely confined to the tubular epithelial compartment. In vitro NLRP3 mRNA and protein expression were transiently induced in HPTC by TGF-β1 but subsequently diminished over time as cells lost their epithelial phenotype in a process regulated by transcription and ubiquitin-mediated degradation. Consistent with the in vitro data, low NLRP3 mRNA expression in kidney biopsies was associated with a linear trend of higher risk of composite endpoint of doubling serum creatinine and end stage renal disease in patients with IgAN. Taken together, these data show that NLRP3 is primarily a kidney tubule-expressed protein that decreases in abundance in progressive IgAN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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