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Enregistrement W2337185978 · doi:10.1158/1538-7445.sabcs14-p5-09-01

Abstract P5-09-01: Nottingham prognostic index plus (NPI+): Validation of the modern clinical decision making tool in breast cancer

2015· article· en· W2337185978 sur OpenAlexaff
Andrew R. Green, Daniel Soria, Jacqueline Stephen, Desmond G. Powe, Christopher C. Nolan, Ian Kunkler, Jeremy Thomas, G.R. Kerr, W Jack, David Camreron, Tammy Piper, Graham Ball, Jonathan M. Garibaldi, Emad A. Rakha, John M.S. Bartlett, Ian O. Ellis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNottingham Prognostic IndexMedicineOncologyInternal medicineStage (stratigraphy)Breast cancerAdjuvant therapyCytokeratinPrognostic variableMitotic indexCancerEstrogen receptorGynecologyImmunohistochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Current management of breast cancer (BC) relies on risk stratification based on well-defined clinicopathologic factors. The Nottingham Prognostic Index Plus (NPI+) is based on the assessment of biological class combined with established clinicopathologic prognostic variables providing improved patient outcome stratification superior to the traditional NPI*. This study aimed to validate the NPI+ in an independent series of BC. Methods A Validation series of 469 primary early-stage BC cases treated in Edinburgh, UK were matched for size, stage and grade to cases from Nottingham, UK used to develop the NPI+ (Training series). Adjuvant therapy was similar in both series except that 143 Edinburgh cases received endocrine therapy whilst the matched Nottingham cases had no adjuvant therapy. However, there was no significant difference in 10 year BC specific survival (BCSS) between the Training and Validation series. Cases, prepared as TMAs, were immunohistochemically assessed for Cytokeratin (Ck)5/6, Ck18, EGFR, Estrogen Receptor (ER), Progesterone Receptor (PgR), HER2, HER3, HER4, Mucin 1 and p53 expression. NPI+ biological class based on the expression of the 10 biomarkers was determined. Subsequent NPI+ prognostic scores were assigned using individual algorithms for each biological class developed using the Training series incorporating clinicopathologic parameters: positive nodes (including nodal stage), tumour size, tumour grade (including mitotic index) and PgR. NPI+ biological classes, prognostic scores and prognostic groups were compared between the Validation and Training series and their role in prediction of patient outcome. A p-value of <0.01 was considered significant. Results As anticipated, there was a comparable distribution of NPI+ biological classes between Training and Validation series: Luminal A, n=143 (31%) vs n=115 (25%); Luminal N, n=99 (21%) vs n=89 (19%); Luminal B, n=75 (16%) vs n=85 (18%); Basal p53 altered, n=54 (12%) vs n=72 (15%); Basal p53 normal, n=37 (8%) vs n=53 (11%); HER2+/ER+, n=31 (7%) vs 18 (4%); HER2+/ER-, n=30 (6%) vs n=37 (8%; X2=13.792, p=0.032). BCSS was analogous between the Validation and Training series in each of the NPI+ biological classes except Luminal B (p=0.042). Similar BCSS was observed in the NPI+ Biological classes of the Training versus Validation series when taking into consideration adjuvant treatment modalities. The mean NPI+ score was similar between the Validation and Training series (2.30 vs 1.89, Pearson’s Regression p=0.079). The NPI+ prognostic groups significantly predicted patient outcome in each molecular class (BCSS, p<0.0001) in the Validation series irrespective of adjuvant treatment. Comparing the BCSS in each of the NPI+ prognostic groups demonstrated there were no significant differences between patient outcome in each of the NPI+ prognostic groups between the Validation and Training series. Conclusion This study validates the NPI+ in an independent series of primary BC confirming its’ reproducibility. The NPI+ provides improved individualised clinical decision making for breast cancer for both prediction of clinical outcome and relevant therapeutic options. Acknowledgements Funded by the MRC References *Rakha EA et al Br J Cancer. 2014 110:1688-97. Citation Format: Andrew R Green, Daniel Soria, Jacqueline Stephen, Desmond G Powe, Christopher C Nolan, Ian Kunkler, Jeremy Thomas, Gill Kerr, Wilma Jack, David Camreron, Tammy Piper, Graham R Ball, Jonathan M Garibaldi, Emad A Rakha, John MS Bartlett, Ian O Ellis. Nottingham prognostic index plus (NPI+): Validation of the modern clinical decision making tool in breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the Thirty-Seventh Annual CTRC-AACR San Antonio Breast Cancer Symposium: 2014 Dec 9-13; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(9 Suppl):Abstract nr P5-09-01.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,107
Tête enseignante GPT0,454
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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