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Enregistrement W2338520984 · doi:10.1139/gen-2015-0156

DNA barcodes and citizen science provoke a diversity reappraisal for the “ring” butterflies of Peninsular Malaysia (<i>Ypthima</i>: Satyrinae: Nymphalidae: Lepidoptera)

2016· article· en· W2338520984 sur OpenAlexvenueno aff
Shi-Wei Jisming-See, Kong‐Wah Sing, John‐James Wilson

Notice bibliographique

RevueGenome · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNaturalis Biodiversity CenterUniversiti Malaya
Mots-clésNymphalidaeSubspeciesBiologyDNA barcodingLepidoptera genitaliaGenusTaxonButterflyZoologyLycaenidaeSynonym (taxonomy)BarcodeEcologyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The "rings" belonging to the genus Ypthima are amongst the most common butterflies in Peninsular Malaysia. However, the species can be difficult to tell apart, with keys relying on minor and often non-discrete ring characters found on the hindwing. Seven species have been reported from Peninsular Malaysia, but this is thought to be an underestimate of diversity. DNA barcodes of 165 individuals, and wing and genital morphology, were examined to reappraise species diversity of this genus in Peninsular Malaysia. DNA barcodes collected during citizen science projects-School Butterfly Project and Peninsular Malaysia Butterfly Count-recently conducted in Peninsular Malaysia were included. The new DNA barcodes formed six groups with different Barcode Index Numbers (BINs) representing four species reported in Peninsular Malaysia. When combined with public DNA barcodes from the Barcode Of Life Datasystems, several taxonomic issues arose. We consider the taxon Y. newboldi, formerly treated as a subspecies of Y. baldus, as a distinct species. DNA barcodes also supported an earlier suggestion that Y. nebulosa is a synonym under Y. horsfieldii humei. Two BINs of the genus Ypthima comprising DNA barcodes collected during citizen science projects did not correspond to any species previously reported in Peninsular Malaysia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,304
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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