MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2338538733 · doi:10.1186/s40478-016-0305-8

Evaluation of alpha-synuclein immunohistochemical methods for the detection of Lewy-type synucleinopathy in gastrointestinal biopsies

2016· article· en· W2338538733 sur OpenAlexaff
Anne-Gaëlle Corbillé, Franck Letournel, Jeffrey H. Kordower, Elisheva D. Shanes, Michel Neunlist, David G. Muñoz, Pascal Derkinderen, Thomas G. Beach

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésStainingPathologyLamina propriaSubmucosaImmunohistochemistryMedicineBiopsyPathologicalH&E stainEpithelium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The observation showing that Lewy type synucleinopathy (LTS), the pathological hallmark of Parkinson's disease (PD), is found in the gut of almost all PD subjects led to a substantial amount of research to develop a diagnostic procedure in living patients based on endoscopically obtained gastrointestinal biopsies. However, the existing studies have provided conflicting results regarding the sensitivity and specificity of gastrointestinal biopsies for the detection of LTS. We therefore undertook a multi-center staining and blinded judging of a common set of slides from colonic biopsies to determine the optimal protocol for the detection of LTS. Four different immunohistochemical methods, developed in four separate expert laboratories, were evaluated for their sensitivity and specificity to detect enteric LTS. Test sets of formalin-fixed, paraffin-embedded sections from biopsies of 9 PD subjects and 3 controls were stained with the 4 methods and graded by 4 different observers. Four types of staining morphology (granular staining in the lamina propria, perivascular/vascular wall staining in the submucosa, lacy-granular pattern in the submucosa and epithelial cell nuclear staining) were variably observed in the slides stained by the 4 methods. Positive alpha-synuclein staining was observed by all 5 judges in most of the slides from control cases, regardless of the staining methods that were used. Moreover, none of the tested method or staining pattern had a specificity and sensitivity more than 80 % regarding to PD. Overall, our study suggest that the tested methods are not adequate for the prediction of PD using gastrointestinal biopsies. Future studies are warranted to test new immunostaining methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,593
Score d'incertitude au seuil0,435

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Neuropathologica CommunicationsMême sujetParkinson's Disease Mechanisms and TreatmentsTravaux en français237 207