Association of NetF-positive type A Clostridium perfringens with necrotizing enteritis in neonatal foals
Notice bibliographique
Résumé
A role for type A Clostridium perfringens in necrotizing enterocolitis of neonatal foals has long been suspected but incompletely characterized. The supernatant of an isolate made from a foal that died from this disease was highly cytotoxic for an equine ovarian (EO) cell line. Partial genome sequencing of an isolate revealed three novel putative toxin genes encoding proteins related to the pore-forming Leukocidin/Hemolysin Superfamily; these were designated netE, netF, and netG. netE and netF were located on one large conjugative plasmid, and netG was located with a cpe enterotoxin gene on a second large conjugative plasmid. Mutation and complementation showed that only netF was associated with the cytotoxicity. There was a highly significant association (p<0.0002) between the presence of netF with type A strains isolated from cases of foal necrotizing enterocolitis. netE and netF were found in all cytotoxic isolates, as was cpe, but netG was less consistently present. Pulsed-field gel electrophoresis showed that netF-positive isolates belonged to a clonal lineage that included canine-origin netF strains; some canine and equine netF-positive isolates were genetically indistinguishable. Equine antisera to recombinant Net proteins showed that only antiserum to rNetF had high supernatant cytotoxin neutralizing activity. The genomes of two C. perfringens strains recovered from a case of foal necrotizing enteritis (JP55) and canine haemorrhagic gastroenteritis (JP838), respectively, were completely sequenced using Single Molecule, Real-Time (SMRT) technology-PacBio and Illumina Hiseq2000. The JP55 and JP838 genomes include a single 3.34 Mb and 3.53 Mb circular chromosome, respectively, and both genomes additionally consist of five circular plasmids. Comparison of these two C. perfringens chromosomes with three fully sequenced reference chromosome sequences identified regions (~69 kb) shared between the two isolates, including regions forming a mosaic of plasmid-integrated segments, suggesting that these elements were acquired early in a clonal lineage of netF-positive C. perfringens strains. In addition, plasmid annotation revealed that both netF-positive C. perfringens strains, JP55 and JP838, harbour three tcp-conjugative plasmids in common, including a NetF/NetE toxins-encoding plasmid, a CPE/CPB2 toxins-encoding plasmid and a putative bacteriocin-encoding plasmid. We also found that JP55 and JP838 strains share unique virulence genes on conserved
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».