Arbuscular mycorrhizal fungal diversity associated with Eleocharis obtusa and Panicum capillare growing in an extreme petroleum hydrocarbon-polluted sedimentation basin
Notice bibliographique
Résumé
Arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) have been extensively studied in natural and agricultural ecosystems, but little is known about their diversity and community structure in highly petroleum-polluted soils. In this study, we described an unexpected diversity of AMF in a sedimentation basin of a former petrochemical plant, in which petroleum hydrocarbon (PH) wastes were dumped for many decades. We used high-throughput PCR, cloning and sequencing of 18S rDNA to assess the molecular diversity of AMF associated with Eleocharis obtusa and Panicum capillare spontaneously inhabiting extremely PH-contaminated sediments. The analyses of rhizosphere and root samples over two years showed a remarkable AMF richness comparable with that found in temperate natural ecosystems. Twenty-one taxa, encompassing the major families within Glomeromycota, were detected. The most abundant OTUs belong to genera Claroideoglomus, Diversispora, Rhizophagus and Paraglomus. Both plants had very similar overall community structures and OTU abundances; however, AMF community structure differed when comparing the overall OTU distribution across the two years of sampling. This could be likely explained by variations in precipitations between 2011 and 2012. Our study provides the first view of AMF molecular diversity in soils extremely polluted by PH, and demonstrated the ability of AMF to colonize and establish in harsh environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».