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Enregistrement W2338767671 · doi:10.1111/sji.12443

<scp>V<sub>H</sub></scp> and <scp>V<sub>L</sub></scp> Domains of Polyspecific IgM and Monospecific IgG Antibodies Contribute Differentially to Antigen Recognition and Virus Neutralization Functions

2016· article· en· W2338767671 sur OpenAlexafffund
Yfke Pasman, Azad Kaushik

Notice bibliographique

RevueScandinavian Journal of Immunology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDairy Farmers of Ontario
Mots-clésAntigenAntibodyEpitopeNeutralizationBiologyVirologyMolecular biologyImmunoglobulin GImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analysed contributions of variable heavy (FdVH ) and variable light (FdVL ) domains in comparison to scFv (FdVH +FdVL ) of naturally occurring polyspecific bovine IgM with an exceptionally long CDR3H and an induced monospecific bovine herpes virus-1 (BoHV-1) neutralizing IgG1 antibody in the context of to antigen-binding site and antibody function. Various recombinant FdVH , FdVL and scFv were constructed and expressed in Pichia pastoris from the bovine IgM and IgG1 antibody encoding cDNA. The scFv1H12 showed polyspecific antigen binding similar to parent IgM antibody, though subtle differences, for example, higher thyroglobulin recognition. Such differences reflect influence of the constant region on the antigen-binding site configuration. Unlike, variable light domain FdVL 1H12, the variable heavy domain FdVH 1H12 alone recognized multiple antigens that differed from the recognition pattern of scFv1H12 (FdVH +FdVL ) and the parent IgM antibody. Nonetheless, role of FdVL 1H12 in providing structural support to FdVH in antigen recognition is noted, apart from its intrinsic antigen recognition ability. Surface plasmon resonance analysis revealed low to moderate affinity of scFv1H12 to IgG antigen. By contrast, the individual FdVH 073 and FdVL 074, originating from induced BoHV-1 neutralizing IgG1 antibody, recognized target epitope on BoHV-1 weakly when compared to FdVH +FdVL (scFv3-18L). Interestingly, both the FdVH and FdVL domains of induced IgG antibody are required to achieve BoHV-1 neutralization. To conclude, there exist subtle functional differences in the contribution of FdVH and FdVL to antigen-binding site generation of polyspecific IgM and monospecific IgG antibodies relevant to antigen recognition and virus neutralization functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,426
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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