Notice bibliographique
Résumé
An OprF-deficient mutant of P. aeruginosa strain M-2 was constructed by Ω mutagenesis. This strain was unable to grow in low osmolarity media and was 70% the length of the parental strain. These results confirmed that these phenotypes were not strain specific. Consistent with the appearance of OprF-deficient strains in clinical situations, an OprF-deficient strain was shown to not have a major growth disadvantage in an in vivo chamber model. Plasmids encoding truncated and cysteine-to-serine mutants of OprF were constructed by linker-insertion mutagenesis, PCR and subcloning of a previously characterized mutant. Analysis of the resulting proteins indicated that between 102 and 163 N-terminal amino acids of OprF was required for protein expression as determined by Western immunoblotting. All of the truncated mutants expressed were associated with the outer membrane, indicating that the N-terminal 163 amino acids of OprF were sufficient for this association. None of the truncated-OprF mutants tested were associated with the peptidoglycan, indicating that more than 215 N-terminal amino acids of OprF are required for this association. Strains that encoded at least two cysteines were 2-mercaptoethanol modifiable. The full-length cloned OprF and the truncated mutant expressing the N-terminal 290 amino acids were normally heat modifiable. When denatured prior to electrophoresis, the remaining truncated mutants had apparent molecular weights lower than those of untreated samples indicating that between 215 and 290 amino acids were required for the protein to be normally heat modified. Although the truncated-OprF mutants were able to grow in low osmolarity media and were significantly longer than the OprF-deficient strain, the C-terminal half of OprF appeared to be required for the wild-type growth and length. The cysteine-to-serine OprF mutants were associated with the outer membrane and were heat modifiable. Analysis of these mutants with and without 2-mercaptoethanol was consistent with the hypothesis that wild-type OprF has two disulphide bonds Monoclonal antibody reactivity with overlapping octapeptides equivalent to the primary sequence of OprF localized three epitopes. Indirect immunofluorescence and opsonic phagocytosis studies identified the surface location of epitopes binding nine OprF-specific monoclonal antibodies. This information was incorporated into an updated secondary structure model of OprF.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».