Commutability of the First World Health Organization International Standard for Human Cytomegalovirus
Notice bibliographique
Résumé
Quantitative detection of cytomegalovirus (CMV) DNA has become a standard part of care for many groups of immunocompromised patients; recent development of the first WHO international standard for human CMV DNA has raised hopes of reducing interlaboratory variability of results. Commutability of reference material has been shown to be necessary if such material is to reduce variability among laboratories. Here we evaluated the commutability of the WHO standard using 10 different real-time quantitative CMV PCR assays run by eight different laboratories. Test panels, including aliquots of 50 patient samples (40 positive samples and 10 negative samples) and lyophilized CMV standard, were run, with each testing center using its own quantitative calibrators, reagents, and nucleic acid extraction methods. Commutability was assessed both on a pairwise basis and over the entire group of assays, using linear regression and correspondence analyses. Commutability of the WHO material differed among the tests that were evaluated, and these differences appeared to vary depending on the method of statistical analysis used and the cohort of assays included in the analysis. Depending on the methodology used, the WHO material showed poor or absent commutability with up to 50% of assays. Determination of commutability may require a multifaceted approach; the lack of commutability seen when using the WHO standard with several of the assays here suggests that further work is needed to bring us toward true consensus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».