MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2339350517

Identification, Molecular Characterization and Alternative Splicing of Three Novel Members of the Canine Kallikrein (Klk)-related Peptidase Family.

2015· article· en· W2339350517 sur OpenAlexaff
Katerina Angelopoulou, George S. Karagiannis

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlternative splicingBiologyRNA splicingExonKallikreinGeneticsComputational biologyGeneMolecular biologyBiochemistryRNAEnzyme
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIM: Kallikrein-related peptidases (KLKs) comprise a serine protease family with prominent roles in tissue physiology and disease pathogenesis, including cancer. Previously, we have characterized canine Klk4-10 and -14. Herein, we continue our efforts by characterizing three novel members of the canine family, i.e. Klk11-13, and investigating their expression in mammary cancer. MATERIALS AND METHODS: Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and DNA sequencing were used for investigating the expression and determining the nucleotide sequence of all transcripts identified, respectively. RESULTS: It was demonstrated that (i) unlike other Klks, (CANFA)Klk12 probably possesses a non-AUG translation initiation codon, (ii) all three Klks undergo alternative splicing, with exon 2 and 3 concurrent elimination serving as the most prominent event, (iii) all transcripts identified were detected in both tumor and normal tissues, yet with different frequencies. CONCLUSION: Having completed this work, Klk15 is the only gene remaining to experimentally resolve the entire canine Klk family. Our data lay sufficient groundwork for validation studies and await further incorporation into genetic/evolutionary studies with translational impact.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePubMedMême sujetCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and AngioedemaTravaux en français237 207