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Enregistrement W2339357024 · doi:10.1093/neuonc/nov228.20

PTPS-20THE GD3 ACETYLATION PATHWAY AS A POTENTIAL THERAPEUTIC TARGET FOR PAEDIATRIC MEDULLOBLASTOMA

2015· article· en· W2339357024 sur OpenAlexaff
Rebecca Mather, K. Stephenson, Laura Donovan, Michael D. Taylor, Reinhard Vlasak, Geoffrey J. Pilkington, Helen L. Fillmore

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaNeural crestApoptosisCancer researchFlow cytometryGangliosideBiologyMedicineImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB), the most common malignant paediatric brain tumour, is associated with high mortality rates. Survivors frequently suffer from low quality-of-life as a result of aggressive treatment. Genomic studies have led to novel classification of molecularly and clinically distinct subgroups and are paving the way for novel targeted therapies. GD3, an oncofoetal ganglioside is re-expressed in some cancers of the neural crest. GD3, central to cell movement in developing brain, is internalised during maturation of residual supernumerary cells leading to cell death. When GD3 is re-expressed in cancers, the intracellular form of GD3 is acetylated (GD3A) and is thought to protect cells from mitochondrially-mediated apoptosis. Sialate-O-acetylesterase (SIAE) is responsible for cleaving the acetyl group from GD3A. A genome-wide transcriptional analysis of 103 MB patients revealed that this enzyme is significantly down-regulated in MB tissue compared to non-neoplastic foetal and adult brain (p > 0.02). This suggests that GD3A may be deacetylated at low levels and thus the balance of GD3 to GD3A favours GD3A. Using flow cytometry to examine expression, results revealed that in MB cell lines RES256 and UW402 GD3A expression was higher (84.5% and 74.5%) than GD3 (56.6% and 61.3%) The fluorescent intensity of GD3A expression was 9.9 and 11.4 fold higher and GD3, 4.4 and 6.1 fold higher than negative controls. Immunocytochemical results were in agreement, providing additional evidence that these cells have a balance in favour of GD3A. Previous studies from our group have shown that cell surface expression of GD3 correlates with invasion and in MB cell lines tested surface expression was 31.7% and 65.7% compared to GD3A (29.5% and 11.5%). Inducible SIAE and SIAE catalytically mutated cell lines have been generated and verified in protein and esterase activity assays and will be used to evaluate this pathway as a potential therapeutic target for MB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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