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Enregistrement W2339557278 · doi:10.14288/1.0166913

Pectin methyl esterification functions in seed development and germination

2014· article· en· W2339557278 sur OpenAlexaff
Gabriel Levesque‐Tremblay

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerminationPectinChemistryBotanyFood scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Homogalacturonan pectin domains are synthesized in a highly methyl esterified form and can be de-methyl esterified by the cell wall enzyme Pectin Methyl Esterase (PME). The prevalent model for PME mode of action indicates that when PMEs act on a stretch of adjacent galacturonic acid glycosides, they may strengthen the cell wall but when PMEs act on non-adjacent galacturonic acid glycosides they may loosen the cell wall. PME activity can be regulated in planta by the proteinaceous inhibitor, PMEI. I used PME and PMEI to study the importance of methyl esterification in seed development and germination. As a means to identify PMEs involved in seed coat mucilage I identified 7 PMEs expressed in the seed coat. The PME gene HIGHLY METHYL ESTERIFIED SEED (HMS) is highly expressed at 7 Day Post Anthesis (DPA) both in the seed coat and the embryo. Using a hms-1 mutant, I showed that HMS is required for normal levels of PME activity and methyl esterification in the seed, mucilage extrusion and proper embryo cell expansion, rigidity and morphogenesis between 4 and 10 DPA. The mucilage extrusion defect is a secondary effect of the function of HMS in the embryo. I hypothesize that HMS is required for cell wall loosening in the embryo to allow for cell expansion during the accumulation of storage reserves. To evaluate the importance of methyl esterification in germination my collaborators and I first showed that PME activity changed during the different stages of germination: it first increased before testa rupture and decreased during endosperm rupture. Treatment with the hormone abscisic acid (ABA) to increase dormancy prolonged PME activity in the seeds. Inversely when we negatively regulated PME activity in the A. thaliana seed with the overexpression of a PMEI (OE PMEI5), we generated larger seeds with bigger cells. These seeds germinated faster both in presence or absence of ABA. Therefore we hypothesize that the PME(s) inhibited by PMEI5 establishes stronger cell walls that restrict germination. This thesis clearly demonstrates that PME activity is important in the regulation of seed cell wall methyl esterification impacting embryo growth and germination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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