International Evaluation of MIC Distributions and Epidemiological Cutoff Value (ECV) Definitions for Fusarium Species Identified by Molecular Methods for the CLSI Broth Microdilution Method
Notice bibliographique
Résumé
The CLSI epidemiological cutoff values (ECVs) of antifungal agents are available for various Candida spp., Aspergillus spp., and the Mucorales. However, those categorical endpoints have not been established for Fusarium spp., mostly due to the difficulties associated with collecting sufficient CLSI MICs for clinical isolates identified according to the currently recommended molecular DNA-PCR-based identification methodologies. CLSI MIC distributions were established for 53 Fusarium dimerum species complex (SC), 10 F. fujikuroi, 82 F. proliferatum, 20 F. incarnatum-F. equiseti SC, 226 F. oxysporum SC, 608 F. solani SC, and 151 F. verticillioides isolates originating in 17 laboratories (in Argentina, Australia, Brazil, Canada, Europe, Mexico, and the United States). According to the CLSI guidelines for ECV setting, ECVs encompassing ≥97.5% of pooled statistically modeled MIC distributions were as follows: for amphotericin B, 4 μg/ml (F. verticillioides) and 8 μg/ml (F. oxysporum SC and F. solani SC); for posaconazole, 2 μg/ml (F. verticillioides), 8 μg/ml (F. oxysporum SC), and 32 μg/ml (F. solani SC); for voriconazole, 4 μg/ml (F. verticillioides), 16 μg/ml (F. oxysporum SC), and 32 μg/ml (F. solani SC); and for itraconazole, 32 μg/ml (F. oxysporum SC and F. solani SC). Insufficient data precluded ECV definition for the other species. Although these ECVs could aid in detecting non-wild-type isolates with reduced susceptibility to the agents evaluated, the relationship between molecular mechanisms of resistance (gene mutations) and MICs still needs to be investigated for Fusarium spp.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,019 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».