Discovery and characterization of olfactory-related genes in the wheat stem sawfly, Cephus cinctus, a major pest of wheat in the northern plains
Notice bibliographique
Résumé
The wheat stem sawfly (WSS), Cephus cinctus (Hymenoptera: Cephidae), is one of the most important insect pests of wheat in the northern Great Plains region of the United States and Canada, with economic losses exceeding $100 million per year. Traditional pest management strategies including pesticides are generally unsuccessful due to an extended adult flight time and the inaccessible larval stage that feeds within the wheat stem. Research towards integrated pest management strategies based on olfaction has proved promising. However, little is known about the molecular basis of olfaction in this important insect pest. We have identified and annotated 131 members of the major olfactory-related gene families from antennal transcriptome and whole genome sequences, including: 6 odorant binding proteins (OBP), 8 chemosensory proteins (CSP), 53 odorant receptors (OR), 14 ionotropic receptors (IR), 12 carboxylesterases (CCE), 8 gluthatione S-transferases (GST), and 29 cytochrome P450s (P450). Expression levels in the antennae, sawfly bodies, and whole larvae were analyzed using RNA-seq. Gene expression results were used to identify candidate genes for further functional characterization based on higher enriched expression in antennae and/or sex-biased expression in the antennae. These candidate WSS olfactory genes may mediate important pest behaviors and serve as molecular targets for future insect management strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».